地心应用 | 基因测序,解决自动聚焦和等间隔触发问题,提高测量精度与效率

專案概述

 

地心科技高精度XYZT 4轴精密定位平台,兼具静态精度与动态精度,完美实现基因测序应用中的快速自动追焦和等间隔触发,在基因测序仪中被广泛使用。

地心科技,对精度的追求永无止境。

 

01 基因测序技术

1977年,Walter GilbertFrederick Sanger发明了第一台基因测序仪,并应用其测定了第一个基因组序列,噬菌体X174,全长5375个碱基。

由此开始,人类获得了探索生命遗传本质的能力,生命科学的研究进入了基因组学的时代。基因测序技术颠覆了传统生物学技术,基因测序技术的出现让我们可以读出一个人所有的遗传信息——人类基因组。

l  1977 Walter Gibert Allan M. Maxam发明了化学降解法测序,Frederick SangerCoulson开创了双脱氧链终止法并完成了第一个噬菌体全基因组的测序

l  1983 Kary Mullis发明PCR作为体外扩增DNA的方法

l  1990年 美国正式启动人类基因组计划

l  1995年 人类基因组物理图谱完成

l  1997年 大肠杆菌基因组测序完成

l  1999年 中国获准加入人类基因组计划

l  2000年 果蝇基因组测序完成

l  2002年 小鼠基因组测序完成

l  2003年 人类基因组计划完成

基因测序技术的发展对人类意义重大。靶向药物、靶向医疗,都基于人的基因组测序。也就是测了序之后,知道某个人的病(尤其是肿瘤)要用哪种药来医。药物的毒副作用预测,也基于基因组测序。也就是说基于基因测序,可以判断哪个药对哪个人有毒。

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02 基因测序的原理与关键点

至今为止的四十年时间内,测序技术已取得了相当大的发展,从第一代发展到了第三代测序技术。

l  一代测序(传统的Sanger测序)

l  二代测序(高通量微阵列芯片技术)

l  三代测序(单分子测序技术和纳米测序技术)

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测序的原理,简单来说就是将DNA信号转变为计算机可处理的数字信号。基因测序通常的流程包括 DNA提取与分段:准备样本,DNA提取, DNA分段, DNA片段末端修复 ;DNA片段扩增(纳米球技术):加接头序列 ,分离出单股DNA,扩增 , 形成DNA纳米球;DNA序列识别,DNA纳米球附着芯片,组合探针锚定连接法测序; 分析碱基读取数据比对和组装,基因组结果分析,得到结果。

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基因测序技术中一个非常重要的部件是基因测序芯片。基因测序芯片中的规则阵列(PatternArray)采用先进的光刻和干法刻蚀技术,在硅片表面形成阵列和对准标记,通过涂敷深紫外光刻胶--阵列图案曝光显影暴露局部硅表面汽相沉积(氨基硅烷修饰)系列处理,来实现DNA纳米球的固定。硅片最后被分切成25mmX 75mm的小片,成为测序芯片的基底。测序时DNA分子锚和荧光探针在DNB上进行聚合,随后高分辨率成像系统对基因芯片上的荧光信号进行采集,光信号经过数字化处理后即可获得待测序列。

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在基因测序工序,一般是先在测序仪中装载测序芯片,调整上升Z轴,芯片浸液;根据检焦反馈,Z轴位置闭环稳定焦面;通过图像反馈确定芯片偏转角度,并按要求转θ轴,摆正芯片位置;然后沿Y方向匀速扫描运动,单列扫描完成后,X方向步进一个视场宽度,Y方向反向扫描,重复执行上述过程,直至整个芯片全部完成扫描。

 

对基因测序芯片进行扫描时,Y轴需要在匀速段等间隔触发系统采集图像,这就要求Y轴必须有很好的速度稳定性。典型应用中,Y轴在匀速段动态跟随误差要小于±70nm

在较大的视场范围内,基因测序芯片表面是不平整的,Y轴扫描的同时Z轴需要实时动态聚焦,误差范围达到±50nm,完成实时聚焦。

基因测序对XYZθ各轴的精度和动态性能有极高的要求,不仅仅需要静态精度高,还需要很好的动态响应。

 

03 地心科技解决方案

地心科技为基因测序应用提供了多种解决方案。XY一体式运动平台CFT-200XY作为系统的底轴,θ轴采用转台RSML放置于XY轴之上,Z轴采用高精度升降台ART130V-5安装于转台上;组成高精度高动态性能的4轴系统。

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CFT-200XY是纳米级定位精度的XY一体式精密定位平台,直线电机直驱控制,采用精密交叉滚柱导轨,具备非常优秀的动态性能和定位精度,空载截止频率最大可达100Hz以上。

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RSML系列是高精度的360度连续转台,采用旋转电机直驱控制,选用精密滚珠轴承,具备非常优秀的动态性能和定位精度,空载截至频率最大可达100Hz以上。RSML系列转台采用杰出的工业化设计,外观精致小巧,转动台面尺寸75mm , 100mm150mm200mm可选,厚度小于60mm。选用高精度圆光栅位置反馈,定位精度小于6角秒,轴跳和端跳小于6μm,机械性能非常突出。

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ART130V-5是纳米级定位精度托举运动升降平台,直线电机驱动,交叉滚珠导轨,具备非常优秀的动态性能和定位精度,空载截止频率可达150Hz以上。ART130V-5系列升降台结构紧凑小巧,最大速度可达75mm/s,空载加速度可达0.7g

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